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Quelqu un peut m expliquer?
Recemment publie dans Le Monde, il y a un article traitant de la desactivation des genes.
En gros ca parle de "l interface ARN".
Bref je sais pas si je suis vraiment bete ou quoi, mais tout ca c est une decouverte nouvelle?
En quoi est ce que ca depasse la technique antisens et le gene knock out?
Bref, j avais l impression que tout ca existait depuis un bail, est ce que c est une decouverte toute nouvelle, ou quoi?
AAhhh je comprend pas...
C est hyper frustrant. Help....

# mimile, le Jeudi 15 Août 2002, 11:11 dans "experimentations diverses".
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Commentaires:

interference
Ecrit par Blaise le Jeudi 15 Août 2002, 22:05

pas interface. l'idee est justement d'empecher l'ARN de faire interface

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Re: interference
Ecrit par mimile le Vendredi 16 Août 2002, 08:58

Mais en quoi est ce que c est nouveau?
Bref, je trouve pas de toute facon que le mot "interface" soit bien explicite.

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Re: Re: interference
Ecrit par Blaise le Vendredi 16 Août 2002, 21:27

interference, te dis-je!

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Re: Re: Re: interference
Ecrit par mimile le Lundi 19 Août 2002, 09:04

bref je retourne a mes bouquins.

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zero l'article
Ecrit par zeemzoom le Lundi 19 Août 2002, 12:38

Je viens de lire cet article et je n'ai qu'une chose a dire : c'est normal que tu n'aies pas compris la decouverte, moi non plus d'ailleurs, puisque nulle part le journaliste n'explique de quoi il s'agit. Bref, on nous dit que c'est un nouveau continent qui est decouvert et on doit le croire sur parole sans meme avoir une idee de ce a quoi ressemble le continent. D'habitude le journalistes scientifiques du Monde sont plus explicites.

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Re: zero l'article
Ecrit par mimile le Lundi 19 Août 2002, 12:43

Apres avoir lu et relu l article, je me demande si c est nouveau par rapport a l antisens (qui lui n a rien de nouveau), car comme les phrases sont tournees, ca reste un peu flou, bref si c est ce que je pense que c est, ca a rien de bien revolutionnaire, mais pour de la vulgarisation scientifique, ca reste obscure, avec beaucoup trop de "buzz word" qui expliquent rien du tout.
je n en dormirai pas moins ce soir!
;)

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Re: Re: zero l'article
Ecrit par zeemzoom le Lundi 19 Août 2002, 12:48

c'est quoi l'antisens ?

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Re: Re: Re: zero l'article
Ecrit par mimile le Lundi 19 Août 2002, 13:09

tu prend un gene, qui est un morceau d ADN, cet ADN est normalement traduit en ARN qui code pour faire les proteines.
La technique antisens, c est quand tu as un gene qui t interesse, et que tu decide de l eteindre en inserant sa propre copie en orientation contraire.
Le gene dans le bon sens va se traduire en ARN, celui dans le sens inverse va creer une copie "antisens du meme ARN.

Bref, les deux brins d ARN se joignent et cela empeche toute protein d etre formee.
Donc grace a ca, tu as reussi a empecher, disons ta tomate, a produire une protein que tu etudie, et tu peux observer l effet que ca a differents niveaux.

Apres pour "bloquer" un gene tu n es pas toujours obliger de l inserer dans le genome, mais tu peux juste injecter des oligos antisesn qui vont venir se coller aux ARN que tu ne veux pas voir se transformer en protein (dans le cas de certaines maladies, par exemple).
J espere ne pas etre trop incomprehensible!

a voir pour plus d info
http://www.isip.com/antisens.htm

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Re: Re: Re: Re: zero l'article
Ecrit par mimile le Lundi 19 Août 2002, 13:23

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Re: Re: Re: Re: zero l'article
Ecrit par zeemzoom le Mardi 20 Août 2002, 11:41

Ah je suis heureux d'apprendre l'existence de cette technique. Neanmoins, il y a encore beaucoup de mysteres et je me pose pas mal de questions :
A. Pourquoi donc deux ARN de chiralite inverse (c'est de ca dont il s'agit ?) s'annulent-ils ? Pourquoi ne continuent-ils pas leur trajet le plus tranquillement du monde, chacun de leur cote ?
B. Que se passe-t-il avec un anti-ARN qui arrive jusqu'au ribosome, est-il traduit normalement ?
J'ai d'autres questions mais je vais les garder pour la suite...

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Re: Re: Re: Re: Re: zero l'article
Ecrit par mimile le Mardi 20 Août 2002, 12:42

L' ARN sens et l ARN antisens se lient sur le principe des bases complementaires A/U, C/G, une fois le complex forme, impossible de transcrire un peptide.
Par contre, c est surement possible que les deux ne se rencontre pas, ne formant donc pas de complex, mais je ne connais pas grand chose sur la question.
Bref, generalement le gene antisens est insere pres du gene a inactive, la proximite doit reduire ce genre de malchance.

Dans le cas d un ARN antisens arrivant seul au ribosome.

Si on prend un ARN message arrivant au ribosome, il entre dans celui ci par le cote "5'", et le peptide sera cree de 5' en 3'. Mais pour pouvoir "accroche" le ribosome, l ARMm a besoin de sequences speciale un peu en amont se son debut en 5' : la region shine Dalgarno.
Deja c est pas gagne pour un ARN antisens injecte (ayant deja pas mal de chance de se faire detruire par les ribonucleases, si il arrive juqu a la sans avoir rencontre l ARN sens, il peut meme pas s accroche.
Apres pour la traslation, il faut, en plus de cette sequence:
Un codon "start" AUG (met) et un codon "stop" (UAA, UAG, UGA)

Dans l hypothese ou ton gene antisens produit un ARN antisens qui manque de rencontrer l ARN sens pour faire un complexe, qu il gagne le ribosome, avec les bonnes sequences d accrochage (je sais meme pas si c est possible), le commencement "5'" aura difficilement un start codon en position, et meme si il en a un, le message etant a l envers, c est fort probable que l "open reading frame" soit brise, et qu il y ai plein de stop codon dans le message...
en imaginant qu un peptide est forme a partir de l antisens, il faut encore que l apoprotein se conforme correctement (structure tertiaire) ce qui est mal barre.
Apres si ca marche, et ben, c est fort probable que l organisme ne sache pas quoi faire de cette molecule, qui sera peut etre degradee.
Apres c est fort possible que je me trompe.

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Re: Re: Re: Re: Re: Re: zero l'article
Ecrit par zeemzoom le Mardi 20 Août 2002, 22:02

"La technique antisens, c est quand tu as un gene qui t interesse, et que tu decide de l eteindre en inserant sa propre copie en orientation contraire"

Je ne comprends pas pourquoi ca me donne un ARN complementaire : le gene est forme de deux brins et il n'y a que l'un d'entre eux qui est transcrit, soit. Mettre un gene en orientation contraire revient alors a obtenir le meme ARN sauf qu'il a ete synthetise en commencant par la fin ou y a-t-il qqch qui m'echappe ?

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Re: Re: Re: Re: Re: Re: Re: zero l'article
Ecrit par mimile le Mercredi 21 Août 2002, 10:59

l ARN est cree( de3' en 5') en traduisant le brin d ADN codant a partir de son bout 5'.
Exemple:

Ton gene d interet:

5' AAACCCTTTGGG 3' 3' TTTGGGAAACCC 5' Son antisens sera:

5' CCCAAAGGGTTT 3' 3' GGGTTTCCCAAA 5' Si tout ca est dispose sur une meme ligne (uniquement brins codants 5'3'):

5'-------AAACCCTTTGGG------------CCCAAAGGGTTT---3' ARNm: 3' TTTGGGAAACCC 5' 3' GGGTTTCCCAAA 5' Les deux ARNm sont complementaires:

3' TTTGGGAAACCC 5' 5' AAACCCTTTGGG 3' Ils forment un duplex, l ARNm du gene initial ne peut pas etre traduit en peptide.

J espere ne pas etre trop brouillonne, sachant que l efficacite c est pas trop mon truc....

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Re: Re: Re: Re: Re: Re: Re: Re: zero l'article
Ecrit par zeemzoom le Mercredi 21 Août 2002, 16:03

Merci , c'est desormais clair comme de l'eau de roche. Je pensais avant que si mon gene etait (brin codant) AAACCCTTTGGG, l'antisens etait tout bonnement GGGTTTCCCAAA mais non il faut aussi realiser l'operation de complementation pour obtenir si j'ai bien compris CCCAAAGGGTTT. Maintenant je comprends pourquoi les deux ARN s'"annulent", je comprends aussi pourquoi le resultat de mon ARN antisens a peu de chances de donner une proteine viable.

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Re: Re: Re: Re: Re: Re: Re: Re: Re: zero l'article
Ecrit par mimile le Mercredi 21 Août 2002, 17:29

en effet GGGTTCCAA est le brin non codant de l antisens.
En fait quand tu insere l antisens dans le genome, il faut respecter les orientations 5' et 3' et aussi brins codant/non-codant.
C est genial, refaisons le monde avec la technique antisens.
Non, sans deconner, c est vraiment bien pour voir la fonction d un gene....

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