y en a marre: Le fond de l'eprouvette
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Aujourd'hui: self-help workshop.
Postulat: En etant realiste, je me rend compte que je suis mal barree. Pour tout.
Application: Toi aussi, participe au grand elan pro-communication, echange, aime ton prochain, bullshiting & co, et donne moi ton avis, tes conseils, sur comment gerer les situations dramatiques suivantes. 

Situation 1: Work & deadline.
Un labo toujours en chantier, des resultats insuffisants a mon gout, un manuscript toujours en chantier lui aussi, des superviseurs pas cool, plus de temps, plus d'argent. Il faut que je reussise a assembler un proto-manuscript pour debut mai, avec le nombre requis de chapitres. 
Comment tirer sur la corde pour reussir a obtenir le manuscript de mes reve, a temps, et surtout avec assez de chapitres pour m'eviter les ricanements desabuses des superviseurs?

Situation 2: Molecular biology
Deux genes candidats assez long [2.4 et 3.4 Kb] GC%>60-65, rare transcripts. Le premier a un stop codon, resultat [apparemment] d'un intron non-episse. Le second est juste merdique.
Impossible de recuperer un full-length transcript, pour evoluer vers heterologous expression [a ce point, j'expresserai n'importe quoi, histoire d'avoir un chapitre en plus].A savoir: pas de library disponible pour l'organisme. Mega deche.
Une methode, solution rapide et efficace pour obtenir les candidats en questions [Killer taq(dea essaye bcp), autre methode]?

Situation 3: Bioinformatics
Une tonne de donnees generees en 3.5 ans des PCR et sequencage varies [bouts de sequences variees]. Besoin de presser le citron au maximum, pour en tirer le plus d'info possible.
Blast, recherche de motifs, ou autre. Quoi faire avec pour obtenir le plus d'infos pseudo-interressante, en restant dans les limites de capacites (limitees) en bioinfo?
De meme: esquisse de base de donnee sous Access, besoin de pousser ca un peu, histoire de rentrer toutes les sequences dedant, si possible passer sous MySQL, et en faire qqchse. Une solution rapide, facile et efficace?

Situation 4: Obscessions & TOC
Besoin incontrolable de en cas de contrariete. Comfort eating --> expanding waistline --> angoisse --> besoinde kitkat.
Quelle alternative?

Situation 5: Bunnyboiling.
Dr A. est toujours bien ancre dans ma tete. Pourtant le combat contre la CoE est injuste et inegal, mais je n'apprend jamais ma lecon, et decide d'en remettre une couche. Un moyen infaillible pour une reussite assuree?

Situation 6: Relations humaines
Demain meeting des enfers. Comment convaincre 3 superviseurs passablement blases que je ne me fout pas de la gueule du monde, non non non, et que oui oui oui, je suis serieuse, je finirai a temps [alors que je n'y crois plus moi meme]?


# mimile, le Lundi 21 Février 2005, 11:40 dans "bienvenue sur l ile maudite".
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Commentaires:


Ecrit par Anonyme le Lundi 21 Février 2005, 11:54

Bah, pour la plupart des points je peux rien pour toi, mais pour la
situation 5 si.

Il est révélé dans South Park que Dieu est mormon. Les fidèles de la CoE se gourent et finiront en enfer (toujours d'après south park, un endroit sympa et gay friendly ou Saddam tronche Lucifer).

Dès lors, pour le Dr. A le choix et simple: déménager à Salt Lake city ou profiter de sa vie terrestre avec toi...

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0_o
Ecrit par Gnaf le Lundi 21 Février 2005, 16:32

Heu, y'a rien d'autre que > dans ce post ?

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Re: 0_o
Ecrit par mimile le Lundi 21 Février 2005, 17:04

Hmpf, ca merdouille... >_<
ca a l'air normal sous l'editeur... arg

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Re: Re: 0_o
Ecrit par Gnaf le Lundi 21 Février 2005, 17:13

Ca y est ça remarche. Moi aussi j'ai un pb avec mon dernier post, une partie du texte a disparu.

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la solution est pourtant évidente
Ecrit par xel le Mardi 22 Février 2005, 00:25

épouser le PDG de Kitkat et lui faire racheter ton labo

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Ecrit par kiara le Mercredi 23 Février 2005, 17:54

(situation 2) Y'a un truc que je capte toujours pas: t'as séquencé le génomique ou pas ??? Brainstorming this saturday if you'd like, alright ?

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Re:
Ecrit par mimile le Mercredi 23 Février 2005, 19:03

Yep, all sequenced. Just a very very very bad template...

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Help is at hand...
Ecrit par Froog le Jeudi 24 Février 2005, 16:07

Bon alors je me rends compte que ce que j'ai écrit (commentaire du 24/02) n'est pas très constructif et ne t'avance pas a grand chose. J'ai donc remis à plus tard quelques meetings important et la soumission de plusieurs articles pour m'atteler a essayer de t'aider a resoudres certains de tes problemes - bon oui faut pas trop en demander.

Alors Problematique nb 1: probleme qui en fait n'en est pas un. Subdiviser les chapitres existants (ou plannifiés) en 2 chapitres ou plus. Résultat meme volume, plus de chapitres ! En plus c'est débile cette histoire de chapitre - mieux vaut 4 bon chapitres solides et de qualité que 15 petits chapitres tout malingres.

Problematique nb 2: ca n'est peut etre pas une solution rapide et pratique mais comme tu as un rare transcript - une petite étape d'amplification non specifique des mRNAs avant ta/tes PCRs te permettrait peut etre le breakthrough ?? (ah ca fait du bien de parler Franglais comme ca...). Si ca te tente je pourrais te passer des refs. Moi je n'y coupe pas car je PCR sur cellules uniques. Et puis maintenant ils font pas des tas de RT qui marchent bien a temperatures elevées ? J'sais pas - j'dit ca comme ca.

Problematique nb 3: alors là pfff... moi je sais faire que des alignements et des recherches de motifs. Des beaux dendrogrammes avec tout plein de couleur ? Non là desolee - faut attendre qu'un bioinfogeek se penche sur ton blog. Mais peut etre c'est deja fait ?

Problematique nb 4: Je suis passée par là aussi - c'est bizzarre moi aussi je suis Francaise et je faisais ma these - il y a comme un pattern... Tu vas voir que si un jour tu quittes le Kingdom United ce TOC te passeras sans laisser de traces alors profite des sources abondantes de auxquelles tu peux t'approvisioner et que tu regretteras peut etre à l'avenir. A ce sujet je suis partie pas tres longtemps apres l'avenement du Chunky et c'est peut etre tant mieux dans un sens. N'oublie pas de remercier Rowntree Mackintosh ou autre dans ta these pour leur importante contribution.

Problematique nb 5: bon la tu parles a moitie en code... mais je crois que je saisis la situation. I say "never give up" j'ai moi meme devoye un fils de pasteur de cette meme CoE qui est maintenant mon mari et que j'ai reussi à extirper du pays. Il m'a fallu 1 an pour atteindre le devoyage et 4 ans pour le mariage mais l'étape 1 m'aurait suffit amplement. Il faut juste multiplier les occasions de rencontre "fortuites" et aussi offrir un cadeau a Noel - dans mon cas ça a marché et pourtant la nature ne m'a pas gatee...

Problematique nb 6: Desolee j'arrive trop tard...

Et pour finir - en tout ce que tu fasses pour/par/à cause etc de cette these - pense d'abord à toi et à tes interets et non pas à ce que les autres/supervisors/collegues etc vont penser/dire. Imagine toi APRES - a ta graduation ceremony (non sans blagues ca vaut le coup rien que pour cette mascarade !!!) et prioritise sinon tu te trouve face à une montagne insurmontable.

Bon c'est tout - j'ai un editeur de Nature qui m'appelle alors je te laisse n'hesite pas à me dire d'aller me faire voir si ca te soulage de quelque facon.

Froog

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A smile on my face
Ecrit par mimile le Jeudi 24 Février 2005, 16:40

Quoi dire a part merci? Le type de reponse que je n'aurais meme pas espere, et a tous les niveaux: bio - these - UK - dietetique - CoE [oooohhhh CoE] - ...

Pour les chunky kit-kats, c'est pure seed of evil, y'en a pas en france? [en meme temps les vending machines, elles sont poucraves en France, ici c'est des Rolls...]

Felicitation pour le fils de pasteur, j'apprecie le tour de force, encore plus pour l'extirpation du pays, et pour Nature. Parce que quand meme hein, si fallait choisir entre Nature et la CoE....

Et oui, y'a comme un pattern... Freaky.

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